pypath.utils.orthology.Proteomes

class pypath.utils.orthology.Proteomes(preload_prot: list[int] | None = None, only_swissprot: bool = True)

Bases: object

__init__(preload_prot: list[int] | None = None, only_swissprot: bool = True)

Methods

__init__([preload_prot, only_swissprot])
get_taxon(protein[, only_swissprot])
get_taxon_trembl(protein)
has_protein(protein)
is_swissprot(protein)
load_proteome(taxon[, only_swissprot])
load_taxonomy()